Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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FAM3AP98173 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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FAM3AP98173 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
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FAM3AP98173 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
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FAM3AP98173 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
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FAM3AP98173 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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FAM3AP98173 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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FAM3AP98173 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
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FAM3AP98173 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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