Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 DDX54-201ENST00000306014 4377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 MYRIP-203ENST00000425621 2981 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 CELSR3-201ENST00000164024 11956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 FOXK1-201ENST00000328914 11181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 SEMA6D-202ENST00000354744 5931 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 CNKSR3-204ENST00000479339 2023 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 PDE9A-201ENST00000291539 2058 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 CACNA1G-219ENST00000507609 6849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 CACNA1G-225ENST00000512389 6837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 BIRC5-201ENST00000301633 2711 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 RIMS1-201ENST00000264839 7055 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 SPG11-203ENST00000535302 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 ARFGEF1-201ENST00000262215 7225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 SYNCRIP-201ENST00000355238 6449 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 CCT3-204ENST00000368259 1815 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 ERBB2-202ENST00000406381 4564 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms