Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 WDR47-204ENST00000369965 4240 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 INHBA-201ENST00000242208 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 AP002008.2-201ENST00000635926 4870 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 MTMR4-204ENST00000579925 5622 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 AMER3-202ENST00000423981 6172 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 TRPV1-209ENST00000576351 2525 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 TRUB2-201ENST00000372890 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 PLEKHB2-202ENST00000403716 4349 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 SETD4-207ENST00000399215 4272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 SFTPA1-202ENST00000419470 2210 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 PCDHGA9-201ENST00000573521 4605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 AL357140.3-201ENST00000639753 1983 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 SHANK2-203ENST00000409161 9208 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 PRR26-201ENST00000381489 7250 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 PML-210ENST00000563500 4502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 RBM19-201ENST00000261741 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 LINC01544-201ENST00000567801 5168 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
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