Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ME1P48163 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ME1P48163 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ME1P48163 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ME1P48163 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ME1P48163 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ME1P48163 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ME1P48163 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ME1P48163 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ME1P48163 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ME1P48163 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ME1P48163 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ME1P48163 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ME1P48163 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ME1P48163 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ME1P48163 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ME1P48163 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ME1P48163 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ME1P48163 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ME1P48163 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ME1P48163 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ME1P48163 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ME1P48163 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ME1P48163 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ME1P48163 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ME1P48163 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ME1P48163 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ME1P48163 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ME1P48163 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ME1P48163 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ME1P48163 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ME1P48163 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ME1P48163 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ME1P48163 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ME1P48163 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ME1P48163 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ME1P48163 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ME1P48163 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ME1P48163 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ME1P48163 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ME1P48163 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ME1P48163 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ME1P48163 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ME1P48163 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ME1P48163 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ME1P48163 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ME1P48163 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ME1P48163 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ME1P48163 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ME1P48163 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ME1P48163 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ME1P48163 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ME1P48163 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ME1P48163 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ME1P48163 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ME1P48163 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ME1P48163 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ME1P48163 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ME1P48163 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ME1P48163 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ME1P48163 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ME1P48163 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ME1P48163 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ME1P48163 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ME1P48163 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ME1P48163 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ME1P48163 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ME1P48163 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ME1P48163 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ME1P48163 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ME1P48163 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ME1P48163 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ME1P48163 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ME1P48163 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ME1P48163 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ME1P48163 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ME1P48163 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ME1P48163 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ME1P48163 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ME1P48163 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ME1P48163 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ME1P48163 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ME1P48163 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ME1P48163 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ME1P48163 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ME1P48163 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ME1P48163 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ME1P48163 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ME1P48163 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ME1P48163 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ME1P48163 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ME1P48163 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ME1P48163 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ME1P48163 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ME1P48163 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ME1P48163 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ME1P48163 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ME1P48163 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ME1P48163 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ME1P48163 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms