Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP8P40818 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP8P40818 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP8P40818 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP8P40818 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP8P40818 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP8P40818 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP8P40818 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP8P40818 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP8P40818 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP8P40818 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP8P40818 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP8P40818 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP8P40818 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP8P40818 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP8P40818 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP8P40818 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP8P40818 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP8P40818 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP8P40818 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP8P40818 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP8P40818 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP8P40818 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP8P40818 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP8P40818 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP8P40818 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP8P40818 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
USP8P40818 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP8P40818 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP8P40818 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP8P40818 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP8P40818 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP8P40818 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP8P40818 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP8P40818 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP8P40818 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP8P40818 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP8P40818 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP8P40818 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP8P40818 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP8P40818 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP8P40818 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP8P40818 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP8P40818 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP8P40818 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
USP8P40818 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP8P40818 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP8P40818 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP8P40818 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP8P40818 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP8P40818 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP8P40818 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP8P40818 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP8P40818 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP8P40818 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP8P40818 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
USP8P40818 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP8P40818 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP8P40818 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP8P40818 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP8P40818 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP8P40818 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP8P40818 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP8P40818 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP8P40818 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP8P40818 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP8P40818 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP8P40818 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP8P40818 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP8P40818 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP8P40818 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP8P40818 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP8P40818 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP8P40818 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP8P40818 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP8P40818 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP8P40818 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP8P40818 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP8P40818 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP8P40818 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP8P40818 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP8P40818 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP8P40818 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP8P40818 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
USP8P40818 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP8P40818 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP8P40818 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP8P40818 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP8P40818 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
USP8P40818 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP8P40818 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP8P40818 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP8P40818 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP8P40818 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
USP8P40818 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP8P40818 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP8P40818 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP8P40818 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP8P40818 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP8P40818 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms