Protein–RNA interactions for Protein: P28066

PSMA5, Proteasome subunit alpha type-5, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA5P28066 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms