Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms