Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 ENTPD4-202ENST00000358689 5861 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms