Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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PTPRAP18433 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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PTPRAP18433 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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PTPRAP18433 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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PTPRAP18433 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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PTPRAP18433 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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PTPRAP18433 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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PTPRAP18433 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms