Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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CTLA4P16410 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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CTLA4P16410 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CTLA4P16410 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CTLA4P16410 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CTLA4P16410 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CTLA4P16410 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CTLA4P16410 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CTLA4P16410 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CTLA4P16410 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CTLA4P16410 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CTLA4P16410 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CTLA4P16410 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CTLA4P16410 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
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