Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAV1P15498 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAV1P15498 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAV1P15498 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VAV1P15498 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAV1P15498 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAV1P15498 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAV1P15498 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAV1P15498 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAV1P15498 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VAV1P15498 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VAV1P15498 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VAV1P15498 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VAV1P15498 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
VAV1P15498 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VAV1P15498 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAV1P15498 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAV1P15498 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VAV1P15498 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
VAV1P15498 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VAV1P15498 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
VAV1P15498 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VAV1P15498 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VAV1P15498 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
VAV1P15498 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VAV1P15498 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VAV1P15498 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAV1P15498 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAV1P15498 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VAV1P15498 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAV1P15498 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAV1P15498 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAV1P15498 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAV1P15498 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAV1P15498 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VAV1P15498 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAV1P15498 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAV1P15498 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VAV1P15498 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAV1P15498 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAV1P15498 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VAV1P15498 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VAV1P15498 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
VAV1P15498 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VAV1P15498 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VAV1P15498 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
VAV1P15498 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VAV1P15498 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VAV1P15498 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
VAV1P15498 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VAV1P15498 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VAV1P15498 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VAV1P15498 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VAV1P15498 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
VAV1P15498 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VAV1P15498 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VAV1P15498 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VAV1P15498 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
VAV1P15498 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
VAV1P15498 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VAV1P15498 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
VAV1P15498 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.02■□□□□ -0
VAV1P15498 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.02■□□□□ -0
VAV1P15498 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VAV1P15498 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
VAV1P15498 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
VAV1P15498 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VAV1P15498 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.02■□□□□ -0
VAV1P15498 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
VAV1P15498 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
VAV1P15498 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
VAV1P15498 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
VAV1P15498 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VAV1P15498 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
VAV1P15498 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.02■□□□□ -0
VAV1P15498 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
VAV1P15498 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
VAV1P15498 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.02■□□□□ -0
VAV1P15498 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
VAV1P15498 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
VAV1P15498 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VAV1P15498 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
VAV1P15498 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
VAV1P15498 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
VAV1P15498 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
VAV1P15498 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VAV1P15498 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VAV1P15498 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
VAV1P15498 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VAV1P15498 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VAV1P15498 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
VAV1P15498 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
VAV1P15498 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VAV1P15498 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
VAV1P15498 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VAV1P15498 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VAV1P15498 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
VAV1P15498 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
VAV1P15498 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VAV1P15498 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms