Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms