Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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