Protein–RNA interactions for Protein: P01258

CALCA, Calcitonin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCAP01258 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCAP01258 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCAP01258 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCAP01258 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCAP01258 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCAP01258 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCAP01258 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCAP01258 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCAP01258 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCAP01258 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCAP01258 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCAP01258 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCAP01258 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCAP01258 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCAP01258 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCAP01258 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCAP01258 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCAP01258 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCAP01258 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCAP01258 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCAP01258 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCAP01258 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCAP01258 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCAP01258 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
CALCAP01258 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCAP01258 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCAP01258 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCAP01258 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCAP01258 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCAP01258 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCAP01258 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCAP01258 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCAP01258 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCAP01258 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCAP01258 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCAP01258 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCAP01258 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCAP01258 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCAP01258 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCAP01258 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCAP01258 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCAP01258 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCAP01258 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCAP01258 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCAP01258 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCAP01258 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCAP01258 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCAP01258 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCAP01258 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCAP01258 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCAP01258 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCAP01258 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCAP01258 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCAP01258 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCAP01258 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCAP01258 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCAP01258 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCAP01258 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCAP01258 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCAP01258 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCAP01258 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCAP01258 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCAP01258 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCAP01258 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCAP01258 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCAP01258 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCAP01258 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCAP01258 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCAP01258 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCAP01258 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCAP01258 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCAP01258 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCAP01258 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCAP01258 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCAP01258 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCAP01258 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCAP01258 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCAP01258 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCAP01258 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCAP01258 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCAP01258 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCAP01258 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCAP01258 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCAP01258 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCAP01258 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCAP01258 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCAP01258 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCAP01258 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCAP01258 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCAP01258 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCAP01258 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCAP01258 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCAP01258 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCAP01258 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCAP01258 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCAP01258 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCAP01258 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCAP01258 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCAP01258 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCAP01258 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms