Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms