Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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SEMA4CQ9C0C4 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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SEMA4CQ9C0C4 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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SEMA4CQ9C0C4 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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SEMA4CQ9C0C4 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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SEMA4CQ9C0C4 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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