Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXM0

PRX, Periaxin, humanhuman

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRXQ9BXM0 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 CALML6-201ENST00000307786 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRXQ9BXM0 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms