Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms