Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms