Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms