Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV35

WDR49, WD repeat-containing protein 49, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR49Q8IV35 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
WDR49Q8IV35 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms