Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RUFY3Q7L099 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RUFY3Q7L099 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RUFY3Q7L099 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RUFY3Q7L099 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
RUFY3Q7L099 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RUFY3Q7L099 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RUFY3Q7L099 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RUFY3Q7L099 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms