Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 SELPLG-203ENST00000550948 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 CPT1C-204ENST00000405931 2785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 TCTN2-202ENST00000426174 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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USP43Q70EL4 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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USP43Q70EL4 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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USP43Q70EL4 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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USP43Q70EL4 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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USP43Q70EL4 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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USP43Q70EL4 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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USP43Q70EL4 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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USP43Q70EL4 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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USP43Q70EL4 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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USP43Q70EL4 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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USP43Q70EL4 IMMT-204ENST00000410111 3001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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USP43Q70EL4 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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USP43Q70EL4 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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