Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 FAM107A-204ENST00000464064 2159 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 CCDC144CP-201ENST00000340196 2823 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 CHL1-201ENST00000256509 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 COL8A1-202ENST00000273342 3029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 FGFR2-202ENST00000346997 2472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 AC036108.2-201ENST00000566974 2562 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 CLDN10-203ENST00000376873 2656 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 C1QTNF3-201ENST00000231338 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 BCL2L2-201ENST00000250405 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 POLN-201ENST00000382865 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 ANKRD62-202ENST00000587848 2919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-203ENST00000636308 4646 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 AC023906.3-201ENST00000559825 874 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 AC120349.1-201ENST00000599498 282 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 AC010503.4-201ENST00000615487 688 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 AL157762.1-201ENST00000619612 415 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 SH3RF2-201ENST00000359120 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 EYA4-208ENST00000452339 2411 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 CHTF8-201ENST00000306585 2561 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 HNRNPF-203ENST00000357065 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 AC063923.1-201ENST00000478982 1619 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 SYBU-203ENST00000408889 2776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 USP24-201ENST00000294383 10549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 OTUD6B-201ENST00000285420 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 IFT172-203ENST00000416524 1982 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 ORMDL2-201ENST00000243045 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 CCNY-203ENST00000374704 3960 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 FUT6-203ENST00000524754 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 PARP6-202ENST00000287196 2625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 CYP1A1-202ENST00000395048 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 ACSBG2-205ENST00000588304 2759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 ZNF200-204ENST00000414144 3306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 AC068896.1-201ENST00000494792 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 HS3ST1-201ENST00000002596 8031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms