Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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