Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 TXNDC17-201ENST00000250101 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 EGFLAM-204ENST00000397202 2398 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
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CTF1Q16619 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 PLA1A-206ENST00000495992 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 KCNIP3-201ENST00000295225 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 DAXX-202ENST00000374542 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 DYNC1I2-204ENST00000409317 2196 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 PSME3-217ENST00000622892 3183 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 MAP2-201ENST00000199940 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 BDH1-203ENST00000392379 3546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 USP2-AS1-202ENST00000500970 1784 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 GALNT15-203ENST00000437509 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 ELOVL6-201ENST00000302274 3090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 KCNH4-202ENST00000607371 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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CTF1Q16619 AGAP12P-202ENST00000603888 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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CTF1Q16619 TMEM25-208ENST00000524725 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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CTF1Q16619 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 2190 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 ALG8-202ENST00000376156 1677 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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CTF1Q16619 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 NEK3-205ENST00000610828 2396 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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CTF1Q16619 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 ACSM2B-201ENST00000329697 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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CTF1Q16619 AC244453.2-201ENST00000457996 3543 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 CCDC60-201ENST00000327554 2450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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CTF1Q16619 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
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CTF1Q16619 SEC24B-202ENST00000399100 3780 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 EDARADD-202ENST00000359362 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 SNX22-201ENST00000325881 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 ADAM32-206ENST00000519315 2168 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 POU2F2-216ENST00000560558 3282 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 NFATC2IP-206ENST00000568148 1157 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
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