Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms