Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 IKBKB-218ENST00000520835 2403 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 AL021155.1-201ENST00000438808 2637 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 AC015819.3-201ENST00000624305 2674 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
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SSX1Q16384 ZNF774-201ENST00000354377 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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SSX1Q16384 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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SSX1Q16384 NHEJ1-201ENST00000356853 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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SSX1Q16384 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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SSX1Q16384 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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SSX1Q16384 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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SSX1Q16384 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
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