Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 AC073957.3-201ENST00000609998 6758 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms