Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms