Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 CALML6-201ENST00000307786 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 PRR23A-201ENST00000383163 801 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 AC133141.1-201ENST00000443015 339 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 HNRNPA3P6-201ENST00000472163 1006 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 PMEL-214ENST00000550447 901 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 AC120498.7-201ENST00000562876 330 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 AC087741.1-204ENST00000573935 646 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 FAM187B2P-201ENST00000577135 713 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 MCM8-AS1-201ENST00000613522 983 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 AC020904.3-201ENST00000624199 442 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 KRTAP10-9-201ENST00000397911 1171 ntAPPRIS P2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 EEF1DP5-201ENST00000431410 772 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
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PTCH1Q13635 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 VDAC1P11-201ENST00000458323 852 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 AC008747.1-201ENST00000592220 442 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 AC008906.2-201ENST00000606656 474 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
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