Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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ITGB3BPQ13352 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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ITGB3BPQ13352 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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