Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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