Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
FMODQ06828 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FMODQ06828 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FMODQ06828 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FMODQ06828 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FMODQ06828 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FMODQ06828 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FMODQ06828 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
FMODQ06828 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FMODQ06828 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FMODQ06828 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FMODQ06828 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FMODQ06828 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FMODQ06828 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FMODQ06828 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FMODQ06828 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FMODQ06828 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FMODQ06828 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FMODQ06828 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FMODQ06828 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FMODQ06828 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FMODQ06828 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FMODQ06828 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FMODQ06828 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FMODQ06828 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FMODQ06828 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FMODQ06828 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FMODQ06828 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FMODQ06828 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FMODQ06828 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FMODQ06828 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FMODQ06828 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FMODQ06828 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FMODQ06828 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FMODQ06828 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FMODQ06828 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FMODQ06828 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
FMODQ06828 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
FMODQ06828 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FMODQ06828 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FMODQ06828 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FMODQ06828 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FMODQ06828 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FMODQ06828 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FMODQ06828 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FMODQ06828 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FMODQ06828 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FMODQ06828 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FMODQ06828 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
FMODQ06828 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FMODQ06828 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FMODQ06828 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FMODQ06828 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FMODQ06828 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FMODQ06828 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FMODQ06828 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FMODQ06828 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FMODQ06828 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FMODQ06828 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FMODQ06828 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FMODQ06828 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FMODQ06828 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FMODQ06828 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FMODQ06828 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FMODQ06828 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
FMODQ06828 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FMODQ06828 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FMODQ06828 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FMODQ06828 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FMODQ06828 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FMODQ06828 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
FMODQ06828 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
FMODQ06828 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
FMODQ06828 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FMODQ06828 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FMODQ06828 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
FMODQ06828 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FMODQ06828 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FMODQ06828 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FMODQ06828 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FMODQ06828 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FMODQ06828 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FMODQ06828 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FMODQ06828 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FMODQ06828 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FMODQ06828 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FMODQ06828 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FMODQ06828 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FMODQ06828 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FMODQ06828 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FMODQ06828 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FMODQ06828 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FMODQ06828 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FMODQ06828 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FMODQ06828 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FMODQ06828 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FMODQ06828 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FMODQ06828 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FMODQ06828 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FMODQ06828 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms