Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms