Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms