Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 SPATA13-203ENST00000382108 8463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 TRPM5-201ENST00000155858 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 TNK2-208ENST00000428187 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 GPR179-204ENST00000621958 7983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 MAP3K9-205ENST00000554752 11169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 RERE-212ENST00000476556 4598 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 ARHGEF2-206ENST00000462460 4438 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 CAPN5-201ENST00000278559 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 PER3-208ENST00000613533 6318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 LINC00846-201ENST00000334165 1778 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 FBXO22-201ENST00000308275 10725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 WNK1-202ENST00000340908 11208 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 ADCY7-201ENST00000254235 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SH3BGRP55822 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms