Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 AC148476.1-201ENST00000622182 705 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRXP46100 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRXP46100 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRXP46100 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRXP46100 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRXP46100 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRXP46100 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRXP46100 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRXP46100 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRXP46100 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRXP46100 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRXP46100 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRXP46100 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRXP46100 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRXP46100 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRXP46100 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRXP46100 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRXP46100 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRXP46100 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRXP46100 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRXP46100 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRXP46100 CD44-203ENST00000278386 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRXP46100 TPT1P9-201ENST00000413759 514 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRXP46100 AL162151.1-201ENST00000423922 561 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRXP46100 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRXP46100 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRXP46100 CNN2P1-201ENST00000453616 918 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRXP46100 AC138781.1-201ENST00000501322 505 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRXP46100 AL162231.1-205ENST00000544078 338 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRXP46100 AL512356.1-201ENST00000548203 535 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRXP46100 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRXP46100 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRXP46100 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRXP46100 AC048380.1-201ENST00000589818 465 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRXP46100 UBA52-213ENST00000599551 707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRXP46100 INTS8-217ENST00000523731 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRXP46100 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRXP46100 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRXP46100 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRXP46100 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRXP46100 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRXP46100 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRXP46100 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRXP46100 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRXP46100 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRXP46100 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRXP46100 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRXP46100 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRXP46100 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRXP46100 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRXP46100 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRXP46100 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRXP46100 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRXP46100 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRXP46100 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRXP46100 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRXP46100 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRXP46100 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRXP46100 CRYZL1-205ENST00000399442 612 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRXP46100 MIR1249-201ENST00000408671 66 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRXP46100 AC011284.1-201ENST00000427920 856 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRXP46100 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRXP46100 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRXP46100 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRXP46100 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRXP46100 AP003043.1-201ENST00000527804 547 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRXP46100 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRXP46100 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRXP46100 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRXP46100 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRXP46100 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRXP46100 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRXP46100 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRXP46100 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRXP46100 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRXP46100 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRXP46100 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRXP46100 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRXP46100 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRXP46100 AL121753.2-201ENST00000624581 1461 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRXP46100 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRXP46100 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRXP46100 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRXP46100 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRXP46100 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRXP46100 CTSD-208ENST00000636843 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRXP46100 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRXP46100 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRXP46100 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRXP46100 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRXP46100 CRYGD-201ENST00000264376 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRXP46100 RNF7-202ENST00000393000 805 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRXP46100 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRXP46100 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRXP46100 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRXP46100 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRXP46100 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRXP46100 AP002336.2-201ENST00000528607 539 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRXP46100 RORA-AS1-202ENST00000558140 869 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRXP46100 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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