Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGAEP38570 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms