Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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