Protein–RNA interactions for Protein: P35226

BMI1, Polycomb complex protein BMI-1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMI1P35226 MYO18B-202ENST00000407587 8090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BMI1P35226 PHF20-203ENST00000374012 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BMI1P35226 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
BMI1P35226 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC11.49□□□□□ -0.57
BMI1P35226 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BMI1P35226 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BMI1P35226 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BMI1P35226 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
BMI1P35226 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BMI1P35226 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BMI1P35226 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
BMI1P35226 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
BMI1P35226 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
BMI1P35226 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BMI1P35226 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
BMI1P35226 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
BMI1P35226 KLHL38-201ENST00000325995 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
BMI1P35226 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
BMI1P35226 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
BMI1P35226 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
BMI1P35226 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
BMI1P35226 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
BMI1P35226 IYD-208ENST00000500320 2158 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
BMI1P35226 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
BMI1P35226 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
BMI1P35226 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
BMI1P35226 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
BMI1P35226 HLA-E-201ENST00000376630 2601 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
BMI1P35226 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
BMI1P35226 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
BMI1P35226 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
BMI1P35226 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
BMI1P35226 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
BMI1P35226 NLGN3-206ENST00000612180 3319 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
BMI1P35226 MTMR4-204ENST00000579925 5622 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
BMI1P35226 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
BMI1P35226 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
BMI1P35226 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
BMI1P35226 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
BMI1P35226 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
BMI1P35226 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
BMI1P35226 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
BMI1P35226 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
BMI1P35226 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
BMI1P35226 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
BMI1P35226 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
BMI1P35226 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
BMI1P35226 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
BMI1P35226 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
BMI1P35226 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
BMI1P35226 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC11.48□□□□□ -0.57
BMI1P35226 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.48□□□□□ -0.57
BMI1P35226 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
BMI1P35226 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
BMI1P35226 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
BMI1P35226 TBX3-201ENST00000257566 4208 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
BMI1P35226 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
BMI1P35226 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
BMI1P35226 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
BMI1P35226 CAPN5-201ENST00000278559 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
BMI1P35226 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
BMI1P35226 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
BMI1P35226 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
BMI1P35226 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
BMI1P35226 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
BMI1P35226 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
BMI1P35226 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
BMI1P35226 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
BMI1P35226 CACUL1-201ENST00000369151 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
BMI1P35226 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
BMI1P35226 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
BMI1P35226 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
BMI1P35226 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
BMI1P35226 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
BMI1P35226 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
BMI1P35226 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
BMI1P35226 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
BMI1P35226 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
BMI1P35226 MYH3-205ENST00000583535 6037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
BMI1P35226 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
BMI1P35226 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
BMI1P35226 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
BMI1P35226 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
BMI1P35226 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
BMI1P35226 ARL13B-210ENST00000535334 3906 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
BMI1P35226 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
BMI1P35226 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
BMI1P35226 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
BMI1P35226 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
BMI1P35226 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
BMI1P35226 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
BMI1P35226 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
BMI1P35226 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
BMI1P35226 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
BMI1P35226 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
BMI1P35226 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
BMI1P35226 C5AR2-201ENST00000595464 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
BMI1P35226 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
BMI1P35226 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
BMI1P35226 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.6 ms