Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 NTNG1-206ENST00000370071 3149 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PLNP26678 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PLNP26678 NUP58-206ENST00000463407 6360 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PLNP26678 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PLNP26678 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PLNP26678 TFDP2-215ENST00000489671 9857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PLNP26678 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PLNP26678 HDLBP-204ENST00000391976 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PLNP26678 ZNF41-202ENST00000377065 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PLNP26678 NAGK-202ENST00000418807 2343 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PLNP26678 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PLNP26678 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PLNP26678 DLGAP3-201ENST00000235180 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PLNP26678 ZNF106-205ENST00000565611 5081 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PLNP26678 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PLNP26678 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PLNP26678 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
PLNP26678 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PLNP26678 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PLNP26678 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PLNP26678 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PLNP26678 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
PLNP26678 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PLNP26678 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
PLNP26678 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
PLNP26678 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
PLNP26678 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PLNP26678 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PLNP26678 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
PLNP26678 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
PLNP26678 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
PLNP26678 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PLNP26678 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
PLNP26678 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PLNP26678 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
PLNP26678 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
PLNP26678 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PLNP26678 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PLNP26678 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PLNP26678 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PLNP26678 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PLNP26678 ABCC3-201ENST00000285238 5716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PLNP26678 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PLNP26678 TUBGCP2-210ENST00000543663 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PLNP26678 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PLNP26678 IL10-202ENST00000423557 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PLNP26678 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
PLNP26678 DNAH10OS-201ENST00000514254 5040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PLNP26678 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
PLNP26678 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PLNP26678 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PLNP26678 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PLNP26678 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PLNP26678 FAM76A-204ENST00000373954 3567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PLNP26678 LINC02188-202ENST00000569740 3775 ntTSL 4 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PLNP26678 ARID4A-206ENST00000431317 5783 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PLNP26678 C2-209ENST00000452323 1999 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PLNP26678 USP20-202ENST00000358355 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PLNP26678 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PLNP26678 FAM90A11P-201ENST00000518378 2218 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
PLNP26678 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PLNP26678 RBM33-203ENST00000341148 7058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PLNP26678 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PLNP26678 RB1-201ENST00000267163 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PLNP26678 ANGPTL2-201ENST00000373417 2575 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PLNP26678 AHI1-205ENST00000457866 5549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PLNP26678 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PLNP26678 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PLNP26678 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PLNP26678 PLCB3-201ENST00000279230 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PLNP26678 PCDHGA12-201ENST00000252085 4747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PLNP26678 NEDD4L-208ENST00000456173 4978 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PLNP26678 BCAS4-202ENST00000371608 6680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PLNP26678 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PLNP26678 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PLNP26678 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PLNP26678 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PLNP26678 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PLNP26678 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PLNP26678 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PLNP26678 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PLNP26678 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PLNP26678 VSTM4-202ENST00000332853 6392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PLNP26678 OTOF-203ENST00000339598 4756 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PLNP26678 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PLNP26678 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PLNP26678 ZNF185-205ENST00000370270 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PLNP26678 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PLNP26678 CCNY-203ENST00000374704 3960 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PLNP26678 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PLNP26678 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PLNP26678 TRIM40-207ENST00000396581 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PLNP26678 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PLNP26678 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PLNP26678 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PLNP26678 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PLNP26678 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
PLNP26678 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
PLNP26678 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
PLNP26678 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms