Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms