Protein–RNA interactions for Protein: P25490

YY1, Transcriptional repressor protein YY1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YY1P25490 AC233724.9-201ENST00000511694 407 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
YY1P25490 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
YY1P25490 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
YY1P25490 DNM1P50-201ENST00000565767 508 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
YY1P25490 INCA1-202ENST00000574617 1260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
YY1P25490 KF455155.1-201ENST00000604493 303 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
YY1P25490 MIR4726-201ENST00000615971 58 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
YY1P25490 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
YY1P25490 CDIPT-AS1-203ENST00000638164 713 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
YY1P25490 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
YY1P25490 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
YY1P25490 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
YY1P25490 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
YY1P25490 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
YY1P25490 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
YY1P25490 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
YY1P25490 WRB-202ENST00000380708 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
YY1P25490 CACNA2D4-209ENST00000538450 1498 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
YY1P25490 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
YY1P25490 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
YY1P25490 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
YY1P25490 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
YY1P25490 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
YY1P25490 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
YY1P25490 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
YY1P25490 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
YY1P25490 TPT1-201ENST00000309246 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
YY1P25490 AC068631.1-228ENST00000354642 742 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
YY1P25490 AL391903.1-201ENST00000407513 365 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
YY1P25490 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
YY1P25490 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
YY1P25490 AC068858.1-201ENST00000525114 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
YY1P25490 AP001107.9-202ENST00000531602 613 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
YY1P25490 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
YY1P25490 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
YY1P25490 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
YY1P25490 AC142381.4-201ENST00000566806 702 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
YY1P25490 AC142086.5-201ENST00000567619 702 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
YY1P25490 MIR22HG-206ENST00000573127 899 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
YY1P25490 AC083798.2-202ENST00000609469 553 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
YY1P25490 FAM230A-201ENST00000615181 315 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
YY1P25490 AC008993.3-201ENST00000633603 631 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
YY1P25490 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
YY1P25490 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
YY1P25490 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
YY1P25490 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
YY1P25490 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
YY1P25490 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
YY1P25490 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
YY1P25490 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
YY1P25490 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
YY1P25490 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
YY1P25490 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
YY1P25490 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
YY1P25490 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
YY1P25490 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
YY1P25490 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
YY1P25490 ECI2-201ENST00000361538 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
YY1P25490 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
YY1P25490 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
YY1P25490 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
YY1P25490 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
YY1P25490 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
YY1P25490 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
YY1P25490 AC234771.1-201ENST00000416873 250 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
YY1P25490 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
YY1P25490 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
YY1P25490 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
YY1P25490 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
YY1P25490 AC009132.1-201ENST00000565194 320 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
YY1P25490 RPL26-206ENST00000582556 763 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
YY1P25490 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
YY1P25490 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
YY1P25490 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
YY1P25490 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
YY1P25490 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
YY1P25490 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
YY1P25490 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
YY1P25490 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
YY1P25490 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
YY1P25490 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
YY1P25490 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
YY1P25490 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
YY1P25490 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
YY1P25490 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
YY1P25490 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
YY1P25490 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
YY1P25490 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
YY1P25490 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
YY1P25490 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
YY1P25490 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
YY1P25490 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
YY1P25490 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
YY1P25490 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
YY1P25490 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
YY1P25490 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
YY1P25490 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
YY1P25490 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
YY1P25490 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
YY1P25490 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms