Protein–RNA interactions for Protein: P23497

SP100, Nuclear autoantigen Sp-100, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP100P23497 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP100P23497 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP100P23497 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP100P23497 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP100P23497 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP100P23497 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP100P23497 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP100P23497 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP100P23497 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP100P23497 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP100P23497 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP100P23497 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP100P23497 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SP100P23497 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP100P23497 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP100P23497 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP100P23497 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP100P23497 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SP100P23497 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SP100P23497 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP100P23497 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP100P23497 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP100P23497 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP100P23497 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP100P23497 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP100P23497 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP100P23497 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SP100P23497 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP100P23497 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP100P23497 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP100P23497 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP100P23497 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP100P23497 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SP100P23497 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP100P23497 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP100P23497 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP100P23497 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP100P23497 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP100P23497 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP100P23497 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP100P23497 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP100P23497 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP100P23497 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP100P23497 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP100P23497 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP100P23497 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP100P23497 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP100P23497 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP100P23497 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP100P23497 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP100P23497 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP100P23497 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP100P23497 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP100P23497 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP100P23497 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP100P23497 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP100P23497 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP100P23497 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP100P23497 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP100P23497 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP100P23497 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP100P23497 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP100P23497 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP100P23497 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP100P23497 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP100P23497 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP100P23497 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP100P23497 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SP100P23497 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SP100P23497 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SP100P23497 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP100P23497 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP100P23497 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP100P23497 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SP100P23497 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP100P23497 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SP100P23497 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP100P23497 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP100P23497 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP100P23497 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP100P23497 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP100P23497 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP100P23497 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP100P23497 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP100P23497 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP100P23497 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP100P23497 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP100P23497 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP100P23497 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP100P23497 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP100P23497 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP100P23497 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP100P23497 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP100P23497 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP100P23497 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP100P23497 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP100P23497 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP100P23497 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP100P23497 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP100P23497 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms