Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DESP17661 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DESP17661 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DESP17661 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DESP17661 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DESP17661 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DESP17661 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DESP17661 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DESP17661 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DESP17661 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DESP17661 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DESP17661 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DESP17661 MAP4K2-201ENST00000294066 7178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DESP17661 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DESP17661 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DESP17661 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DESP17661 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DESP17661 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DESP17661 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DESP17661 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DESP17661 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DESP17661 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DESP17661 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DESP17661 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DESP17661 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DESP17661 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DESP17661 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DESP17661 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DESP17661 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DESP17661 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DESP17661 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DESP17661 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DESP17661 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DESP17661 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DESP17661 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DESP17661 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DESP17661 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DESP17661 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DESP17661 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DESP17661 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DESP17661 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DESP17661 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DESP17661 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DESP17661 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DESP17661 CENPP-203ENST00000375587 8766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DESP17661 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DESP17661 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DESP17661 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DESP17661 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DESP17661 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DESP17661 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DESP17661 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DESP17661 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DESP17661 CFAP65-208ENST00000453220 5877 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DESP17661 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DESP17661 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DESP17661 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DESP17661 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DESP17661 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DESP17661 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DESP17661 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DESP17661 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DESP17661 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DESP17661 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DESP17661 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DESP17661 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DESP17661 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DESP17661 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DESP17661 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DESP17661 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DESP17661 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DESP17661 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DESP17661 INF2-202ENST00000330634 7578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DESP17661 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DESP17661 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DESP17661 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DESP17661 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DESP17661 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DESP17661 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DESP17661 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DESP17661 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DESP17661 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DESP17661 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DESP17661 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DESP17661 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DESP17661 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DESP17661 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DESP17661 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DESP17661 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DESP17661 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DESP17661 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DESP17661 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DESP17661 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DESP17661 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DESP17661 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DESP17661 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DESP17661 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DESP17661 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DESP17661 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DESP17661 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.9 ms