Protein–RNA interactions for Protein: O43345

ZNF208, Zinc finger protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 1,280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF208O43345 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms