Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms