Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms