Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT0

TTC7A, Tetratricopeptide repeat protein 7A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 858 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7AQ9ULT0 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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